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随着国家职能部门的整合、十二五规划及新版药品经营质量管理规范（GSP）的逐步执行，确实可以解决当前人民群众希望解决的问题，特别是对当前的药品行业是前所未有的改变。但同时也体现出一些弊端：
1、权利下放，虽然确实提高了办事效率，但同时也形成同市级的各个县级操作不统一，因为原本统一的制度到各地方时标准就会相应的变形。如：开办企业、公司、单体店在同市的各个县需要提供的资料不一样，因为无形的会形成一股地方保护势力。
2、执业药师准入制度的不严谨，随着执业药师的需求量大，放宽了准入门槛，如一些（护士、医师、检验等等）只要与医药沾边的都可以报考。而这些人考取证书后，有百分之九十九都挂牌，真正从事药学服务的没有几人。如果要真正实行药师人员零距离的为广大人民服务。首先应该从源头（准入制度）做起，因为药品是关系人民生命、关系国家的强盛、名族的兴衰等等，是头等大事。
3、对举报检举事件力度不够，按现行程序。即使你跨级举报。最终来核实人员还是检举人员属地监督管理机构，属地企业不会把核实情况全部如实上报。一是为了自己的前途，如实上报，上级领导会说自己监管不力。不上报也没办法交差。所以会报一点。二是：属地监督部门会无疑的支持本土企业，本土企业能把自己抬高，有时还能获利。检举制度就好比雷声大、雨点小。
4、鼓励连锁发展与执业药师自身价值有所冲突，实行连锁化管理，确实有利于统一管理，也确实体现执业药师的存在。但也带来执业药师薪资问题，因为按现行规定。单体店要开办药店，至少需要两名执业药师，这样单体店将会减少三分之二，都是也连锁的形式发展。确实对药品行业带来实处。可是也让执业药师的就业无疑大部份人都必须是前往连锁工作，这样连锁公司将会压低执业药师的薪资。那执业药师的药学服务价值就得不到体现。应该要让执业药师像执业医师那些体现药学人员的价值所在。
5、政策规章制度不够透明化，其实真正一线服务工作的还是执业药师等药学人员，可是有几个能弄清楚政策呢？按现行办法和程序，首先是国家局对各省级相应监管人员培训，然后各省级部门再组织个市级人员培训，最终到各地方监管人员培训。特别是对新筹办企业造成很大的困惑，因为你咨询一般是咨询属地监管部门，可是有一部分属地监管部门会提出一些难的门槛让你去翻。可是如果你直接咨询上级部门，而得到的回复是请咨询属地监管部门，这样会使企业永远都被属地监管部门牵着走，任其刁难，不能得罪，不能埋怨。如果能够将企业相关人员和属地监管部门人员都由省级统一以同一样的标准培训。这样就可以做到国家政策的公平化、透明化。也会使企业越走越好、越来越强大。同时至少可以起到监督属地监督管理部门的工作。
6、认证管理员的分配不合理，按现有程序及政策，百分之九十九的认证人员都是药品监督管理局的内部工作人员，而真正生产、批发、零售的质量管理人员有参与的都只是很少一部分，这样就会导致关系企业生存的GSP认证变得很神圣，如果每个企业都有一个质量管理人员通过培训而成为GSP认证员的一名而参与的话。就可以打破认证时的一些作弊行为。同时还可以跟好的让企业做好、做对GSP 的相关条件。以利于企业跟好的进行GSP相关培训与管理。在认证时。有相当一部分药监工作人员其实根本没有实际工作经验，都只是一毕业就进入药监考取公务员，存在很多的纸上谈兵现象。
7、执业药师法出台尽快，按现有新版GSP的规定，新开办企业投资人必须是执业药师，但是企业投资人不是执业药师，一样可以聘请执业药师做企业负责人。这样还是解决不了问题的存在。只有执业药师出台后强行规定。如果查实执业药师做企业负责人非真正投资人或经举报属实将予以吊销执业药师证书资格。这样才能杜绝一些纯粹以赚钱为目的的不法商人，更好的保证人民的用药安全。
8、药监工作人员公务员的招聘条件应该有所提高，特别是药监工作人员公务员招聘应该是具备一个最主要的条件：就是最少要在：生产、批发、零售从事过两年及以上的工作人员。否则，将会存在纸上谈兵、不切实际的政策与要求出现，本人从事药品行业15年以来。屡见不鲜。早已习惯为常，这样根本体现不了药监为人民服务的话语，以体现不了国家提出的减少程序，提高办事效率。
9、执业药师人员配备的执行范围不够、执行力度不强，现在只在零售强行执行，而生产、医疗药房未要求，所以会导致不时的出现什么毒药品、违规食品、保健品等。如果在生产、医疗以强行实行投资人或负责人是执业药师或执业医师等人员。可以很大程度上杜绝大部分现象。因为只要违规就掉销其证书，这样很多人还是不愿去冒险的。
10、药品食品药品监督管理局分管药品的副局应该实行向社会公开招聘，其任期应实行5年一调，可以杜绝违规、暗箱操作现象的发生。以可以杜绝偏袒现象。因为现在的属地药监局长都是属地政府任命。基本都不懂本局得业务。等5年一满，就又换岗位了。这样才能更好的管理当地的药品行业，更好的发展。
11、强化对执业药师的管理：可以通过药师人员购买5险一金、每天2小时按取指纹等方式杜绝药师挂牌现象。这样可以让监管人员实时的查询药师人员的在岗情况，指纹安装时应设定一对一IP地址。别的IP地址不能安装。因为指纹可以花2千元复制。
12、应当取消获得执业药师证书人员的属地GSP培训，鼓励执业药师人员有自主选择就业的地域，按现有政策，药学人员要变更就业地域。需要取得变更地域属地药监部门自行举办的GSP岗位培训。有的地域是一个月举行一次。是可以的。可有的地域是一季度一次。甚至半年一次，如果错过。只能等待。这样就有地方保护政策的出现。在浙江的个地市就是这样。除了宁波不这样。
13、应尽快完善执业药师查询制度；按现行政策，药学人员变更区域和地点，有的药监部门需要提供之前工作的属地药监部门开具的离职证明方可就业。有的药监部门不会跟你开区这个证明。原因是没有这个规定。那就自相矛盾。既然都是药监部门，为何有的要、有的不要这个证明呢？
14、应该实行药学人员与药品监管人员相互监督政策；通过企业质量管理的药学人员与监管人员同等的参与省局GSP、GMP等培训，这样，才能更好的监督执法人员的合法性、公平、平等性。如果不这样，执法人员即使不正确的执法，而企业不知道，又不敢言。如果执法人员知道企业有一位跟他一样懂相关的政策、措施及条件。那执法人员至少要顾及一些。如若不然，就会像现在一样，企业根本知道，随便怎么举报，还不是通过一级一级的委托，最终还是我们来核实举报情况。
其实、药品、食品、保健、医疗行业是关系国民的生命、健康、关系名族的兴衰，国家的兴旺都是密切不可分的。只要政策透明、执法严正、人员自律。药品行业事业是会蒸蒸日上，越来越好，是可以揭掉中国药都有毒的不好言传。作为国人，我们都有义务让每个人吃上放心的食品、药品、保健品，用好化妆品、器械。让我们每个人都用实际行动来证明！
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